芹菜主要蟲害是蚜蟲，可用康福多噴殺。病害有斑點病、霜霉病、斑枯病等真菌性病害及細菌性軟腐病等，綜合防治方法如下：
（1）實行輪作，并加強各項栽培管理，收獲后清除殘株病葉，做好田園清潔工作。
（2）采用抗病品種，培育壯苗。對于芹菜斑枯病、斑點病，除加強種子檢疫工作外，可采用48℃溫水浸種30分鐘，進行種子消毒，浸種時不斷攪拌，浸后立即投入冷水中降溫。
（3）對軟腐病的防治，應做好雨后排水工作，發病后暫時控水，降低土壤濕度；培土宜用生土或凈土，選擇晴天無露水時進行，并注意避免操作引起傷口，減少侵染機會。
（4）藥劑防治參考其它蔬菜有關方法。
（5）采收
芹菜特別是西芹，采收時間長，可根據市場需求分批采收。一般采用隔行采收，未采收的植株能夠繼續生長。
（1）實行輪作，并加強各項栽培管理，收獲后清除殘株病葉，做好田園清潔工作。
（2）采用抗病品種，培育壯苗。對于芹菜斑枯病、斑點病，除加強種子檢疫工作外，可采用48℃溫水浸種30分鐘，進行種子消毒，浸種時不斷攪拌，浸后立即投入冷水中降溫。
（3）對軟腐病的防治，應做好雨后排水工作，發病后暫時控水，降低土壤濕度；培土宜用生土或凈土，選擇晴天無露水時進行，并注意避免操作引起傷口，減少侵染機會。
（4）藥劑防治參考其它蔬菜有關方法。
（5）采收
芹菜特別是西芹，采收時間長，可根據市場需求分批采收。一般采用隔行采收，未采收的植株能夠繼續生長。
