近期，財政部、農業部印發了《關于全面推開農業“三項補貼”改革工作的通知》，將種糧農民直接補貼、農作物良種補貼和農資綜合補貼合并為農業支持保護補貼，新的政策目標是為了支持耕地地力保護和糧食適度規模經營。值得注意的是，在耕地地力保護中，政策將減少化肥農藥用量、施用有機肥等措施與補貼掛鉤。
改革后，80%的農資綜合補貼存量資金，加上種糧農民直接補貼和農作物良種補貼資金，將用于耕地地力保護。補貼對象原則上為擁有耕地承包權的種地農民。鼓勵各地創新方式方法，以綠色生態為導向，提高農作物秸稈綜合利用水平，引導農民綜合采取秸稈還田、深松整地、減少化肥農藥用量、施用有機肥等措施，切實加強農業生態資源保護，自覺提升耕地地力。
通知明確，對已作為畜牧養殖場使用的耕地、林地、成片糧田轉為設施農業用地、非農業征（占）用耕地等已改變用途的耕地，以及長年拋荒地、占補平衡中“補”的面積和質量達不到耕種條件的耕地不再給予補貼。
此外，20%的農資綜合補貼存量資金，加上種糧大戶補貼試點資金和農業“三項補貼”增量資金，統籌用于支持糧食適度規模經營。
中國社科院農村發展研究所研究員李國祥表示，新的農業補貼機制把規模經營、新型主體培育與一般農戶糧食生產能力的保護有機結合起來。一部分是給農戶，繼續按照承包地面積發放，條件就是耕地不要撂荒，地力不要下降。規模農戶的種植補貼，根據種植規模單獨發放。
財政部、農業部要求各地力爭于6月30日前將兌現到農民手中的補貼資金發放到位。耕地地力保護補貼將以“一卡（折）通”方式直接兌現到農戶。
自2004年起，國家先后實施了農業三項補貼政策。2015年，三項農業補貼改革在部分省份試點。2016年，新的農業補貼政策在全國正式推開。
