在蘑菇栽培中，下列畸形菇的產生比例較高，發生的原因及防止措施如下：
地雷菇 因是粗土粒噴濕后菇房通風量過大，溫度偏低，覆細土過遲和細土粒過濕等，使實體原基著生部位過低，原基在長大過程中受到周圍土粒的擠壓，菇形不圓整，菇表面帶泥土像“地雷”狀。
防止方法 加強水分管理，粗、細土噴濕要適時、緩慢，粗土粒噴濕后減少通風，保持房內空氣相對濕度在80%左右，促使菌絲向上面生長。
空心菇 出菇期間菇房空氣濕度過低，菇體水分蒸發快，土面噴水少，迅速生長的子實體得不到水分的補充，就會在菇柄產生白色的髓部，甚至菇柄中空，產生空心菇。
防止方法 在蘑菇盛期，要加強水分管理，及時噴水不使土層過干，使快速生長的子實體能夠得到充足的水分，以減少空心菇的發生。
球形菇 覆蓋粗土前老菌塊未挖除，料層厚薄不勻，菌床面干濕不均等，都會使幾個或十幾個子實體成叢地長在一起，形成大小不一的球狀菇體。采摘大菇時，小菇受到牽連、損傷，球菇擁擠成團，還會減少成品菇。
防止方法 撒播或穴播前應及時挖出老菌塊或適當增加土層厚度，鋪覆平整。
傘狀菇 氣溫突然下降，細土濕度偏高且菇房溫度偏低，夜間冷風吹進菇房產生較大的溫差，會使未成熟的幼菇發生菌褶與菌柄脫離，促成幼菇提早開傘。
防止方法 避免冷風突然吹進菇房，注意保溫，并使菌床保持適宜含水量，幼菇即可在低溫下健壯生長。
密小菇 由于覆土過薄，菌絲冒過細土，水分供應斷斷續續，出菇不正常，都會造成出菇密而多，致使菇小體輕，質量差。
防止方法 采取追肥，及時增補覆土，輕噴勤噴水，保持正常濕度。
薄皮菇 培養料發酵不足，過薄，過干，粗土含水不夠，出菇密度大，濕度忽低忽高，子實體生長快、成熟早，均能造成菇體柄細且薄。
防止方法 培養料要適度腐熟，料層要鋪有一定厚度，不能過干，注意控制出菇節奏。
銹斑菇 子實體出土后，若床面噴水后不及時通風，菇房空氣濕度過大，菇蓋上積聚水滴部位便會出現鐵銹色的斑點，從而降低菇的質量。
防止方法 每次噴水后，菇房須適當通風，以散發掉菇體表面的水分。
小蓋菇 菌床覆土過厚，粗土顆粒偏大，覆土時間過遲，土層長時間偏干，冬季用煤加溫引起一氧化碳濃度過高，農藥輕度傷害等，都會造成柄長蓋小或柄粗蓋小的菇體。
防止方法 土粒不可過大、過硬，覆土不要過遲，出菇期及時調節水分，禁止使用農藥并適當通風。
紅根菇 自然氣溫偏高，料面噴水太多，尤其是采菇前噴水過重，通風不良，常會使菇腳發紅。
防止方法 出菇期土層含水不宜過多，采摘前停止噴水及調節通風量。
鱗片菇 氣溫偏低，菇房偏干，氣溫及干濕度變化迅速等，易使菌蓋生出鱗片。
防止方法 出菇前要提高菇房的相對濕度并盡量保持平衡。
地雷菇 因是粗土粒噴濕后菇房通風量過大，溫度偏低，覆細土過遲和細土粒過濕等，使實體原基著生部位過低，原基在長大過程中受到周圍土粒的擠壓，菇形不圓整，菇表面帶泥土像“地雷”狀。
防止方法 加強水分管理，粗、細土噴濕要適時、緩慢，粗土粒噴濕后減少通風，保持房內空氣相對濕度在80%左右，促使菌絲向上面生長。
空心菇 出菇期間菇房空氣濕度過低，菇體水分蒸發快，土面噴水少，迅速生長的子實體得不到水分的補充，就會在菇柄產生白色的髓部，甚至菇柄中空，產生空心菇。
防止方法 在蘑菇盛期，要加強水分管理，及時噴水不使土層過干，使快速生長的子實體能夠得到充足的水分，以減少空心菇的發生。
球形菇 覆蓋粗土前老菌塊未挖除，料層厚薄不勻，菌床面干濕不均等，都會使幾個或十幾個子實體成叢地長在一起，形成大小不一的球狀菇體。采摘大菇時，小菇受到牽連、損傷，球菇擁擠成團，還會減少成品菇。
防止方法 撒播或穴播前應及時挖出老菌塊或適當增加土層厚度，鋪覆平整。
傘狀菇 氣溫突然下降，細土濕度偏高且菇房溫度偏低，夜間冷風吹進菇房產生較大的溫差，會使未成熟的幼菇發生菌褶與菌柄脫離，促成幼菇提早開傘。
防止方法 避免冷風突然吹進菇房，注意保溫，并使菌床保持適宜含水量，幼菇即可在低溫下健壯生長。
密小菇 由于覆土過薄，菌絲冒過細土，水分供應斷斷續續，出菇不正常，都會造成出菇密而多，致使菇小體輕，質量差。
防止方法 采取追肥，及時增補覆土，輕噴勤噴水，保持正常濕度。
薄皮菇 培養料發酵不足，過薄，過干，粗土含水不夠，出菇密度大，濕度忽低忽高，子實體生長快、成熟早，均能造成菇體柄細且薄。
防止方法 培養料要適度腐熟，料層要鋪有一定厚度，不能過干，注意控制出菇節奏。
銹斑菇 子實體出土后，若床面噴水后不及時通風，菇房空氣濕度過大，菇蓋上積聚水滴部位便會出現鐵銹色的斑點，從而降低菇的質量。
防止方法 每次噴水后，菇房須適當通風，以散發掉菇體表面的水分。
小蓋菇 菌床覆土過厚，粗土顆粒偏大，覆土時間過遲，土層長時間偏干，冬季用煤加溫引起一氧化碳濃度過高，農藥輕度傷害等，都會造成柄長蓋小或柄粗蓋小的菇體。
防止方法 土粒不可過大、過硬，覆土不要過遲，出菇期及時調節水分，禁止使用農藥并適當通風。
紅根菇 自然氣溫偏高，料面噴水太多，尤其是采菇前噴水過重，通風不良，常會使菇腳發紅。
防止方法 出菇期土層含水不宜過多，采摘前停止噴水及調節通風量。
鱗片菇 氣溫偏低，菇房偏干，氣溫及干濕度變化迅速等，易使菌蓋生出鱗片。
防止方法 出菇前要提高菇房的相對濕度并盡量保持平衡。
