一、真菌性病害
1、褐腐病。又稱白腐病、水泡病。病菌孢子通過覆土帶入菇房，由空氣和害蟲傳播。當菇房空氣不流通，遇高溫高濕時發病重。在菇床上形成大量白色菌絲體，感病后，子實體菌柄腫大成泡狀，嚴重時形成畸形菇，變為褐色，或形成菌蓋菌柄不分的白色絮狀菌球。防治方法：主要對覆土進行消毒。將覆土置于空房內，按每平方米5毫升甲醛加3克高錳酸鉀的比例熏蒸24小時后，才能使用。菇床上若發現病菇，應立即停止噴水，通風降溫至15℃以下，濕度不超過85%，在病區噴1%-2%甲醛液。發病嚴重的菇床應更換覆土，燒毀病菇，將所用工具用4%甲醛液消毒。
2、軟腐病。由泡毒菌感染引起。病菌孢子多數通過氣流和濺起的水滴傳播，覆土過潮及低溫高濕，易發生此病。發病時，若不及時處理，病菌便迅速蔓延，并變成水紅色。子實體被感染后，逐漸變成褐色，直至腐爛。防治方法：減少床面噴水，加強茹房通風，降低土面和空氣濕度，發病部位撒石灰或噴4%甲醛液；也可噴灑多菌靈或托布津或潰瘍靈500倍液等。
3、褐斑病。又叫干泡病、輪枝霉病，由輪枝霉菌引起。病菌孢子常粘結成堆，主要通過濺起的水滴和菇蠅、螨類、人手、工具等傳播。此病多發生在栽培后期，發病后，先在菌蓋上產生許多不規則針頭狀的褐色斑點，以后斑點逐漸擴大，并產生凹陷，凹陷部分呈灰白色。病菇常干裂，菌蓋歪斜畸形，菇柄出現剝皮現象。但菇體不腐爛，沒有特殊臭味。防治方法：嚴防菇蠅進入菇房；一切工具用4%甲醛液消毒；已發病的地方用500倍液多菌靈等噴灑。
二、細菌性病害
1、斑點病。由托藍氏假單孢桿菌引起。這種病菌在自然界分布很廣，通過害蟲及操作人員傳播，在高溫高濕下易發病，夏秋季節發生較重。發病初期，菌蓋一二處出現黃褐色變色區，隨即變成暗褐色凹陷斑點。此病的防治關鍵是控制好空氣的相對濕度，尤其在蘑菇生長后期，菇房濕度不要超過85%，避免菇蓋表面積水和土面過濕。減少溫度波動，最好低于17℃。發病后用600倍液漂白粉噴灑。
2、干腐病。又叫干僵病，也是一種假單孢桿菌引起的。發病區蘑菇畸形，蒼褐色，菌蓋歪斜，菌柄基部膨大，并且逐漸萎縮干枯，失去食用價值。防治方法：主要是隔離，防止病區和無病區之間菌絲體連接。箱栽時，如果茹箱之間菌絲不相接，干腐病就不會傳播；在菇床上，每隔一段用塑料薄膜隔開，也可阻止蔓延。
三、生理性病害
1、硬開傘。蘑菇遇異常氣候，幼嫩子實體提早開傘的現象叫硬開傘。一般在18℃以下，溫差10℃左右，或突然降溫情況下發生，防治方法：在氣溫突變前做好保溫工作，并增加菇房內的空氣相對濕度。
2、畸形菇。形成的原因是覆土粗細不一，出菇部位低；菇房二氧化碳含量超過0.3%，以及藥害和病害、蟲害造成。防治方法：注意覆土質量和通風，避免有害氣體進入菇房，注意防治病蟲害。
3、薄皮菇。整個出菇階段都可發生。主要由菇房內溫度過高過低，或床面通風過度引起。防治方法：高溫時要加強通風，低溫或起大風時，菇房要保溫保濕。
四、病毒性病害
病毒病是通過罹病的孢子和菌絲傳播。菌絲感染病毒后，不能形成子實體；菌蕾感染病毒后，子實體發育畸形，或菌柄奇長，開傘極早，或菌柄彎曲菌蓋特小，或菌柄下部尖削，或菌柄中央膨大成桶狀、壇狀，最后導致菇體萎蓿干癟成海綿狀。嚴重感染病毒的菇床上，常出現大塊無菇區。防治方法：發現病毒病后，蘑菇一定要在開傘前采完，防止病菇散發出來的孢子傳播；用低劑量溴甲燒熏蒸全部培養床架；將所有用具全部煮沸消毒。如果發病和蔓延嚴重，可根據病毒的寄生侵染性高度專一的特點，改變栽培種類，即可杜絕此病。
1、褐腐病。又稱白腐病、水泡病。病菌孢子通過覆土帶入菇房，由空氣和害蟲傳播。當菇房空氣不流通，遇高溫高濕時發病重。在菇床上形成大量白色菌絲體，感病后，子實體菌柄腫大成泡狀，嚴重時形成畸形菇，變為褐色，或形成菌蓋菌柄不分的白色絮狀菌球。防治方法：主要對覆土進行消毒。將覆土置于空房內，按每平方米5毫升甲醛加3克高錳酸鉀的比例熏蒸24小時后，才能使用。菇床上若發現病菇，應立即停止噴水，通風降溫至15℃以下，濕度不超過85%，在病區噴1%-2%甲醛液。發病嚴重的菇床應更換覆土，燒毀病菇，將所用工具用4%甲醛液消毒。
2、軟腐病。由泡毒菌感染引起。病菌孢子多數通過氣流和濺起的水滴傳播，覆土過潮及低溫高濕，易發生此病。發病時，若不及時處理，病菌便迅速蔓延，并變成水紅色。子實體被感染后，逐漸變成褐色，直至腐爛。防治方法：減少床面噴水，加強茹房通風，降低土面和空氣濕度，發病部位撒石灰或噴4%甲醛液；也可噴灑多菌靈或托布津或潰瘍靈500倍液等。
3、褐斑病。又叫干泡病、輪枝霉病，由輪枝霉菌引起。病菌孢子常粘結成堆，主要通過濺起的水滴和菇蠅、螨類、人手、工具等傳播。此病多發生在栽培后期，發病后，先在菌蓋上產生許多不規則針頭狀的褐色斑點，以后斑點逐漸擴大，并產生凹陷，凹陷部分呈灰白色。病菇常干裂，菌蓋歪斜畸形，菇柄出現剝皮現象。但菇體不腐爛，沒有特殊臭味。防治方法：嚴防菇蠅進入菇房；一切工具用4%甲醛液消毒；已發病的地方用500倍液多菌靈等噴灑。
二、細菌性病害
1、斑點病。由托藍氏假單孢桿菌引起。這種病菌在自然界分布很廣，通過害蟲及操作人員傳播，在高溫高濕下易發病，夏秋季節發生較重。發病初期，菌蓋一二處出現黃褐色變色區，隨即變成暗褐色凹陷斑點。此病的防治關鍵是控制好空氣的相對濕度，尤其在蘑菇生長后期，菇房濕度不要超過85%，避免菇蓋表面積水和土面過濕。減少溫度波動，最好低于17℃。發病后用600倍液漂白粉噴灑。
2、干腐病。又叫干僵病，也是一種假單孢桿菌引起的。發病區蘑菇畸形，蒼褐色，菌蓋歪斜，菌柄基部膨大，并且逐漸萎縮干枯，失去食用價值。防治方法：主要是隔離，防止病區和無病區之間菌絲體連接。箱栽時，如果茹箱之間菌絲不相接，干腐病就不會傳播；在菇床上，每隔一段用塑料薄膜隔開，也可阻止蔓延。
三、生理性病害
1、硬開傘。蘑菇遇異常氣候，幼嫩子實體提早開傘的現象叫硬開傘。一般在18℃以下，溫差10℃左右，或突然降溫情況下發生，防治方法：在氣溫突變前做好保溫工作，并增加菇房內的空氣相對濕度。
2、畸形菇。形成的原因是覆土粗細不一，出菇部位低；菇房二氧化碳含量超過0.3%，以及藥害和病害、蟲害造成。防治方法：注意覆土質量和通風，避免有害氣體進入菇房，注意防治病蟲害。
3、薄皮菇。整個出菇階段都可發生。主要由菇房內溫度過高過低，或床面通風過度引起。防治方法：高溫時要加強通風，低溫或起大風時，菇房要保溫保濕。
四、病毒性病害
病毒病是通過罹病的孢子和菌絲傳播。菌絲感染病毒后，不能形成子實體；菌蕾感染病毒后，子實體發育畸形，或菌柄奇長，開傘極早，或菌柄彎曲菌蓋特小，或菌柄下部尖削，或菌柄中央膨大成桶狀、壇狀，最后導致菇體萎蓿干癟成海綿狀。嚴重感染病毒的菇床上，常出現大塊無菇區。防治方法：發現病毒病后，蘑菇一定要在開傘前采完，防止病菇散發出來的孢子傳播；用低劑量溴甲燒熏蒸全部培養床架；將所有用具全部煮沸消毒。如果發病和蔓延嚴重，可根據病毒的寄生侵染性高度專一的特點，改變栽培種類，即可杜絕此病。
