金魚有著多種體色，它們是由黑色色素細胞、橙黃色色素細胞和淡藍色的反光組織組成的。由于這3種成分的重新組合，各種色素細胞的數目及其分布以及色素的數量與色素的聚集或分散等均能變更它們的外觀，于是魚體的顏色就發生了變化。這些性狀是遺傳的。
金魚中有一種全身都是深藍色的，稱為藍魚。藍魚有藍龍睛、藍高頭、藍水泡、藍丹風等不同品種。另一種身體的顏色介于深棕色和棕色之間，這種魚俗稱為紫色。紫魚也有紫龍睛、紫高頭、紫珍珠等不同品種。
藍色魚在自交繁殖中所得到的后代全部為藍色，這證明藍色魚是不分離的，是屬純種，藍魚與灰色魚(野生鯽魚)作正、反交時，所得后代都具有與鯽魚完全相同的灰色。這表明灰色是顯性(在雜交子1代中表現出某一親代的性狀稱為顯性)，藍色是隱性(在雜交子1代中不表現出某一親代的性狀稱為隱性)。紫色魚在自交繁殖中所得的后代均為紫色，說明紫色魚也是不分離的，也是純種。藍魚和紫魚雜交所得的后代并不產生藍色和紫色，而是產生深灰色和黑色。而雜交子1代兄妹交配所得的雜交子2代中非藍色的魚有4325尾，藍色魚有1383尾，它們之間的比例是3：1。這些結果說明：金魚的藍色為l對隱性基因所控制。野生型的等位基因是顯性，當它存在時，就會產生灰色、黑色或其他非藍色。當紫魚與鯽魚雜交時，所得的子1代全部為灰色，和鯽魚的顏色一樣，可見紫色也是隱性。雜交子1代與紫魚回交時，所產生的下一代絕大部分是灰色(2867尾)的，而紫色魚的數量僅占極少數(189尾)，跟15：1的比例相吻合。
因此，可認為紫色是受4對基因支配，只有4對基因隱性純合子時，才可以發育成紫色(aabbccdd)。如4種顯性等位基因有任何一種參加，魚的顏色就要發育成灰色、黑色或非紫色。紫魚與非紫色的正反交實驗產生了相同的結果，證明這4對基因并不是伴性遺傳的。
由藍魚和紫魚雜交而產生的一種純合體不分離的紫藍色金魚品種，這種魚是受5對隱性基因控制的。其他體色的遺傳，在遺傳實驗研究中也是很有興趣的問題，而且也是很復雜的。因為在金魚的個體發育過程中，常有褪色的現象。各品種金魚的幼魚階段幾乎是差不多的，都具有灰褐色，由于色素細胞的部分消失而轉變成成魚的體色。墨色金魚則因黑色色素細胞增加而形成黑色，在2―3年內常褪成橙紅色。這種褪色性對墨龍睛的非褪色性來說是顯性。橙紅色金魚則常褪成白色。這些褪色過程的中間狀態就形成了雜斑金魚。
金魚中有一種全身都是深藍色的，稱為藍魚。藍魚有藍龍睛、藍高頭、藍水泡、藍丹風等不同品種。另一種身體的顏色介于深棕色和棕色之間，這種魚俗稱為紫色。紫魚也有紫龍睛、紫高頭、紫珍珠等不同品種。
藍色魚在自交繁殖中所得到的后代全部為藍色，這證明藍色魚是不分離的，是屬純種，藍魚與灰色魚(野生鯽魚)作正、反交時，所得后代都具有與鯽魚完全相同的灰色。這表明灰色是顯性(在雜交子1代中表現出某一親代的性狀稱為顯性)，藍色是隱性(在雜交子1代中不表現出某一親代的性狀稱為隱性)。紫色魚在自交繁殖中所得的后代均為紫色，說明紫色魚也是不分離的，也是純種。藍魚和紫魚雜交所得的后代并不產生藍色和紫色，而是產生深灰色和黑色。而雜交子1代兄妹交配所得的雜交子2代中非藍色的魚有4325尾，藍色魚有1383尾，它們之間的比例是3：1。這些結果說明：金魚的藍色為l對隱性基因所控制。野生型的等位基因是顯性，當它存在時，就會產生灰色、黑色或其他非藍色。當紫魚與鯽魚雜交時，所得的子1代全部為灰色，和鯽魚的顏色一樣，可見紫色也是隱性。雜交子1代與紫魚回交時，所產生的下一代絕大部分是灰色(2867尾)的，而紫色魚的數量僅占極少數(189尾)，跟15：1的比例相吻合。
因此，可認為紫色是受4對基因支配，只有4對基因隱性純合子時，才可以發育成紫色(aabbccdd)。如4種顯性等位基因有任何一種參加，魚的顏色就要發育成灰色、黑色或非紫色。紫魚與非紫色的正反交實驗產生了相同的結果，證明這4對基因并不是伴性遺傳的。
由藍魚和紫魚雜交而產生的一種純合體不分離的紫藍色金魚品種，這種魚是受5對隱性基因控制的。其他體色的遺傳，在遺傳實驗研究中也是很有興趣的問題，而且也是很復雜的。因為在金魚的個體發育過程中，常有褪色的現象。各品種金魚的幼魚階段幾乎是差不多的，都具有灰褐色，由于色素細胞的部分消失而轉變成成魚的體色。墨色金魚則因黑色色素細胞增加而形成黑色，在2―3年內常褪成橙紅色。這種褪色性對墨龍睛的非褪色性來說是顯性。橙紅色金魚則常褪成白色。這些褪色過程的中間狀態就形成了雜斑金魚。
