保護地西瓜病蟲害主要有細菌性病害、炭疽病、根結線蟲病、蔓枯病、白粉病、溫室白粉虱、潛葉蠅等。其發生特點與防治方法如下：
立枯病 主要發生在育苗中期，通過雨水、流水、沾有帶菌土壤的農具以及帶菌的堆肥傳播。病菌生長適溫為17～28℃，高溫有利于菌絲的生長發育。土壤濕度偏高，光照不足，易發病。防治方法：苗床發現病株要及時拔除，每星期噴1次銅銨合劑（硫酸銅2份，硫酸銨15份，熟石灰4份，混勻后密閉24小時，使用時藥粉1份加400倍水）。大田定植后發病植株用70%敵克松原粉稀釋成1000～1500倍液灌根。
幼苗猝倒病 苗期發病，幼苗基部呈水漬狀病斑，逐漸變為黃褐色，干枯收縮，突然倒伏。低溫（10～15℃）高濕、光照不足易引起侵染發病。防治方法：苗期發現少數猝倒病苗應及時將病苗連同周圍的病土移到苗床外燒毀，并用70%百菌清、70%敵克松500倍液灌根。
炭疽病 整個生長期都能發病，主要危害幼苗、葉片和果實。靠雨水或灌溉水沖濺傳染，近地處蔓葉常先發病。溫度在10～30℃時均可發病，濕度越大發病越快，以溫度24℃和95%高濕條件下發病最盛。防治方法：發病初期對葉面噴50%多菌靈500～800倍液，或65%代森鋅500～700倍液，或70%百菌清500～700倍液，或25%瑞毒霉800倍液。
根結線蟲病 近幾年來西瓜根結線蟲病發病十分普遍。主要以病土、病苗及灌溉水傳播。病菌發育適溫為25～30℃，10℃以下停止活動。在地勢高燥、土壤質地疏松、鹽分低的情況下發病重，多年連作的地塊發病也重。防治方法：深翻土地，清除病殘體等能壓低病原基數。高溫高濕殺滅法操作簡便，效果好，成本低。另外用阿維菌素、辛硫磷乳油或晶體敵百蟲稀釋液灌根，有一定防治效果。
蔓枯病 經風吹、雨濺傳播危害。20～30℃為發育適宜溫度。高溫多濕，通風透光不良，施肥不足或植株生長弱時，葉片受害重。防治方法：可用75%百菌清可濕性粉劑600倍液，每隔5～7天噴1次，連噴2～3次。還可用70%甲基托布津可濕性粉劑800～1000倍液防治。
白粉病 田間濕度大、溫度在16～24℃時發病最重。防治方法：發病初期要摘除病葉，及時噴藥，可選用50%甲基托布津可濕性粉劑1000液，或75%百菌清可濕性粉劑500～800倍液，或農抗120水劑200倍液噴霧。一般間隔5～7天噴灑1次，連噴3～4次。
溫室白粉虱 繁殖的適溫為18～21℃，成蟲有趨黃習性。防治方法：消滅溫室蟲源，通風口設置防蟲網，在種植前用22%的敵敵畏煙劑棚內消毒。可用黃板誘殺成蟲。也可用10%撲虱靈乳油1000倍液，或25%滅螨猛乳油1000倍液，或2.5%天王星乳油3000倍液噴霧。
潛葉蠅 當幼苗受害時，應立即用80%敵敵畏乳油2000倍液，或用90%敵百蟲1000～1500倍液噴霧。
立枯病 主要發生在育苗中期，通過雨水、流水、沾有帶菌土壤的農具以及帶菌的堆肥傳播。病菌生長適溫為17～28℃，高溫有利于菌絲的生長發育。土壤濕度偏高，光照不足，易發病。防治方法：苗床發現病株要及時拔除，每星期噴1次銅銨合劑（硫酸銅2份，硫酸銨15份，熟石灰4份，混勻后密閉24小時，使用時藥粉1份加400倍水）。大田定植后發病植株用70%敵克松原粉稀釋成1000～1500倍液灌根。
幼苗猝倒病 苗期發病，幼苗基部呈水漬狀病斑，逐漸變為黃褐色，干枯收縮，突然倒伏。低溫（10～15℃）高濕、光照不足易引起侵染發病。防治方法：苗期發現少數猝倒病苗應及時將病苗連同周圍的病土移到苗床外燒毀，并用70%百菌清、70%敵克松500倍液灌根。
炭疽病 整個生長期都能發病，主要危害幼苗、葉片和果實。靠雨水或灌溉水沖濺傳染，近地處蔓葉常先發病。溫度在10～30℃時均可發病，濕度越大發病越快，以溫度24℃和95%高濕條件下發病最盛。防治方法：發病初期對葉面噴50%多菌靈500～800倍液，或65%代森鋅500～700倍液，或70%百菌清500～700倍液，或25%瑞毒霉800倍液。
根結線蟲病 近幾年來西瓜根結線蟲病發病十分普遍。主要以病土、病苗及灌溉水傳播。病菌發育適溫為25～30℃，10℃以下停止活動。在地勢高燥、土壤質地疏松、鹽分低的情況下發病重，多年連作的地塊發病也重。防治方法：深翻土地，清除病殘體等能壓低病原基數。高溫高濕殺滅法操作簡便，效果好，成本低。另外用阿維菌素、辛硫磷乳油或晶體敵百蟲稀釋液灌根，有一定防治效果。
蔓枯病 經風吹、雨濺傳播危害。20～30℃為發育適宜溫度。高溫多濕，通風透光不良，施肥不足或植株生長弱時，葉片受害重。防治方法：可用75%百菌清可濕性粉劑600倍液，每隔5～7天噴1次，連噴2～3次。還可用70%甲基托布津可濕性粉劑800～1000倍液防治。
白粉病 田間濕度大、溫度在16～24℃時發病最重。防治方法：發病初期要摘除病葉，及時噴藥，可選用50%甲基托布津可濕性粉劑1000液，或75%百菌清可濕性粉劑500～800倍液，或農抗120水劑200倍液噴霧。一般間隔5～7天噴灑1次，連噴3～4次。
溫室白粉虱 繁殖的適溫為18～21℃，成蟲有趨黃習性。防治方法：消滅溫室蟲源，通風口設置防蟲網，在種植前用22%的敵敵畏煙劑棚內消毒。可用黃板誘殺成蟲。也可用10%撲虱靈乳油1000倍液，或25%滅螨猛乳油1000倍液，或2.5%天王星乳油3000倍液噴霧。
潛葉蠅 當幼苗受害時，應立即用80%敵敵畏乳油2000倍液，或用90%敵百蟲1000～1500倍液噴霧。
