瓜葉菊主要蟲害有蚜蟲、溫室白粉虱。
一、蚜蟲：蚜蟲群居在瓜葉菊的芽、花蕾、花柄及葉片面取食，嚴重時使受害葉片呈不規則卷曲，使花梗扭曲畸形，花朵不能正常開放，蚜蟲為害的同時還排出大量蜜露，覆蓋在葉片表面，導致煤污病發生。
防治方法：用40%的氧化樂果乳油1000位液噴霧防治。
二、溫室白粉虱：別名小白蛾。喜群集在葉片背面，用象針一樣的口器刺吸汁液，使葉片正面退綠變黃。
防治方法：
（1）用色板誘殺與拒避，在出入口懸掛白色或銀白色塑料條，可拒避成蟲侵入。
（2）釋放溫室白粉虱的天敵麗蚜小蜂。
（3）用10%撲虱靈乳油1000倍液，20%的滅掃利乳油1500-2000倍液噴霧。
