平菇生產過程中，由于管理措施不到位，環境條件不適宜，常易形成畸形菇。生產中應查明畸形菇形成的原因，并采取有效的防治措施。
一、球形或燒瓶形：平菇的菌柄呈球形或燒瓶形，表面不平或扭曲呈波浪狀，菌蓋不能形成，只有很小的一點或有明顯的冰凌狀條紋，這是由病毒感染所致。應用病毒K、病毒A、消菌靈噴霧或涂抹防治。
二、花椰菜形：平菇的子實體原基不斷增大，小柄強烈分杈，形成如同花椰菜的半球狀。這是由于栽培環境中二氧化碳濃度過高、空氣濕度接近飽和所致。應加強通風，降低二氧化碳濃度和空氣濕度。
三、珊瑚形：平菇的菌柄不長粗或不形成菌蓋而又繼續重復分杈，結果形成珊瑚狀，顏色花白。這是由于二氧化碳濃度過高和光照太弱所致。應加強通風，改善光照條件。
四、豆芽菜形：平菇菌柄細長，菌蓋極小或無菌蓋。這是由于菌蓋在形成時溫度太低且持續時間過長所致。所以在菌蓋形成期，如遇0度左右低溫應設法增溫保暖。
五、粗柄：平菇菌柄粗長，呈水腫狀，菌蓋畸形，很小或無。這是由于平菇子實體分化期遇高溫、光照偏強和二氧化碳濃度過高，物質代謝受干擾，引起瘋長所致。應通風降溫，改善光照條件。
六、菇體皺縮干枯：平菇生長瘦弱，子實體呈黃白色或淡黃褐色，菇體從頂向下萎縮干枯。這是由于培養缺水或因空氣濕度過低所致。應及時給培養料補水。
七、形狀不規則：平菇的平切原基形成后，不分化形成菌柄和菌蓋，而長成不規則菌塊，后期菌蓋扭曲開裂并露出菌肉。這是由于敵敵畏、速滅殺丁等農藥用量過多所致。應少用或不用農藥。
一、球形或燒瓶形：平菇的菌柄呈球形或燒瓶形，表面不平或扭曲呈波浪狀，菌蓋不能形成，只有很小的一點或有明顯的冰凌狀條紋，這是由病毒感染所致。應用病毒K、病毒A、消菌靈噴霧或涂抹防治。
二、花椰菜形：平菇的子實體原基不斷增大，小柄強烈分杈，形成如同花椰菜的半球狀。這是由于栽培環境中二氧化碳濃度過高、空氣濕度接近飽和所致。應加強通風，降低二氧化碳濃度和空氣濕度。
三、珊瑚形：平菇的菌柄不長粗或不形成菌蓋而又繼續重復分杈，結果形成珊瑚狀，顏色花白。這是由于二氧化碳濃度過高和光照太弱所致。應加強通風，改善光照條件。
四、豆芽菜形：平菇菌柄細長，菌蓋極小或無菌蓋。這是由于菌蓋在形成時溫度太低且持續時間過長所致。所以在菌蓋形成期，如遇0度左右低溫應設法增溫保暖。
五、粗柄：平菇菌柄粗長，呈水腫狀，菌蓋畸形，很小或無。這是由于平菇子實體分化期遇高溫、光照偏強和二氧化碳濃度過高，物質代謝受干擾，引起瘋長所致。應通風降溫，改善光照條件。
六、菇體皺縮干枯：平菇生長瘦弱，子實體呈黃白色或淡黃褐色，菇體從頂向下萎縮干枯。這是由于培養缺水或因空氣濕度過低所致。應及時給培養料補水。
七、形狀不規則：平菇的平切原基形成后，不分化形成菌柄和菌蓋，而長成不規則菌塊，后期菌蓋扭曲開裂并露出菌肉。這是由于敵敵畏、速滅殺丁等農藥用量過多所致。應少用或不用農藥。
