在正常情況下，播種后7-10天，培養料面上就可以看到小菇蕾。菇蕾剛長出時，呈現灰白色，一二天后迅速長大如鳥卵，3-4天后大如鵪鶉蛋。當草菇由基部較寬、頂部稍尖的寶塔形變為卵形，菇體飽滿光滑，由硬實變松，顏色由深變淺，包膜未破裂，菌蓋、菌柄沒有伸出時采收最好。這時菇味鮮美，蛋白質含量高，品質最好。因此，草菇應在包被沒有破裂的卵狀階段及時性采收，一般早、午、晚各采收一次。采收草菇，動作要輕，應一手按住草菇生長的部位，一手將草菇左右旋扭，輕輕摘下。切忌拔取，以免牽動菌絲，弄亂料堆，影響以后出菇。如果是叢生菇，最好是等大部分都適合采收時，一齊采摘，以免因采收個別菇而造成大量幼菇死亡。采收后的草菇，應立即進行處理。處理方法是立即送市場鮮銷，或送罐頭廠制作罐頭，或速凍，或烘干制成干草菇。根據外貿出口需要，也可制作鹽漬草菇。
