農村土地承包經營權登記，是確認和保護農民的土地承包經營權，保障土地流轉交易安全，完善農村土地承包經營制度的一項基礎性工作。建立農村土地承包經營權登記制度，推進農村土地承包經營權登記，具有多方面的重要意義。
第一，農村土地承包經營權登記，是確認和保護農民土地財產權利的基本手段。
土地承包經營權是農民的一項重要財產權利，是國家法定的一種用益物權。長期以來，土地承包經營權以合同管理為主，缺少嚴格規范的國家登記。雖然農村土地承包合同管理比較健全，絕大部分土地承包經營權的歸屬是清楚的，但是，土地承包經營權所對應的物即承包地塊的四至界限不清晰、面積不準確。土地承包經營權登記是國家對合法土地承包經營權的進一步確認。它要求以法律保護的承包合同、轉讓或互換合同為依據，進行更為嚴格、規范、科學的調查、指界、測量、公示，確認承包地塊的歸屬、坐落、四至、面積，并在土地權屬證書和登記簿中加以記載，解決長期沒有解決的承包地塊面積不準、四至不清的問題。建立土地承包經營權登記制度，由政府確認農民的土地承包經營權，有利于提高農民的土地財產權利意識，提高全社會對農民土地承包經營權物權性質的認識，促進對農民土地承包經營權更為嚴格的物權保護。
第二，農村土地承包經營權登記，是保障土地流轉健康發展的基礎平臺。
農村土地承包以來，國家從政策上一直允許農民流轉土地，但是由于沒有嚴格進行確權登記頒證，承包地塊的權屬界限不清晰、合同面積不準確，農民以出租等方式流轉土地經營權后，在收回土地時其權益很容易受到侵害。建立土地承包經營權登記制度，推進土地承包經營權初始登記，開展經常性的土地承包經營權變更登記，搭建土地承包經營權登記信息服務平臺，通過登記確認土地承包經營權是否存在、是否變動、變動內容等，有利于保障土地承包經營權轉讓、出租、轉包、互換、入股等流轉方式中雙方的權益，減少土地流轉糾紛，減少市場上的欺詐行為，降低市場信息搜尋成本和交易費用，提高土地市場效率，有序發展土地適度規模經營。
第三，農村土地承包經營權登記，是完善和落實農業農村公共管理政策的重要工具。
許多農業農村公共管理政策都與土地聯系在一起，土地承包經營權登記是完善和落實農業農村公共管理政策的一個重要工具。比如，現階段對種糧農民的直接補貼就與土地承包合同面積掛鉤，由于土地承包經營權登記體系沒有建立起來，承包地塊的權屬界限不清晰、合同面積不準確，直接影響到政策的公平性、可操作性和有效落實。開展農村土地承包經營權登記，建立完善的土地承包經營權登記體系，有利于為土地利用規劃、耕地保護、土地整治開發、農業補貼、農村社會管理等公共管理政策的制定和決策提供依據，并在政策落實中提高可操作性，降低執行成本。
第四，農村土地承包經營權登記，是進一步深化農村土地制度改革的前提條件。
我國農村土地制度改革已經取得了重大成就，但是改革進程并沒有結束，農村土地承包經營制度還存在需要進一步改革完善的地方。全面深化農村土地制度改革，需要在改革已經取得成就的基礎上穩妥推進。土地承包經營權確權登記頒證，有利于在穩定土地承包關系的基礎上落實長久不變的政策，賦予農民長久而有保障的土地承包經營權；有利于在開展土地產權抵押質押擔保融資的改革中提供可靠的操作工具；有利于在確認和保護農民土地承包經營權的基礎上配套推進征地制度改革，實現對被征地農民的公正補償。
第五，農村土地承包經營權登記，同時也是在農業農村落實依法治國方略的一項基礎工作。
我國《物權法》和《農村土地承包法》等法律就土地承包經營權登記做了明確規范，提供了基本依據，規定了具體要求。依法建立土地承包經營權登記制度，推進土地承包經營權確權登記頒證，是落實《物權法》和《農村土地承包法》等法律的有關規定以及法律確立的農村土地承包經營制度的一項基礎工作，對于全面推進農業農村領域的法治建設具有重要的現實意義。
