阿合奇縣積極在本地柯爾克孜羊品質改良工作上下功夫，通過組建核心群養殖基地、對種公畜補貼、羊人工受精等方式，有效提高了本地羊品質，取得了良好經濟效益，推動了阿合奇縣畜牧業健康有序發展。
組建核心群，促進柯爾克孜羊的品種改良。目前，阿合奇縣已建立柯爾克孜羊核心群25個，其中，政府出資籌建21個，個人自籌建設4個。核心群共有基礎母羊3750只，種公羊175只，經鑒定，核心群內所產羔羊出生重平均提高0.4公斤，種公畜平均體重提高2.6公斤。
對種公畜進行補貼，推動種公羊推廣使用。阿合奇縣通過對種公畜進行補貼的方式鼓勵養殖戶進行柯爾克孜羊品種改良，按照國家活畜良種補貼政策，每交易一只 帶有自治區良補耳標的種公畜羊可獲國家補貼800元。截至目前，共有6950只柯爾克孜種公羊享受了種公畜補貼，有力促進了優良種公畜的推廣使用。
加強柯爾克孜羊人工授精推動羊品質改良。近三年來，阿合奇縣共投入資金15萬元，完成人工授精柯爾克孜羊5640只，通過人工授精所產羔羊，平均出生體重增加0.7公斤，成年體重增加2.8公斤。
